国际阶段的主要程序：
一、受理专利申请和对专利进行形式审查
PCT专利申请人一旦提出PCT国际专利申请就相当于在全部成员国同时提出专利申请。
中国专利局作为PCT受理局认为专利申请文件和专利申请手续完备的，即确定国际申请日。国际申请日表示自该申请日起，PCT国际申请在每一个成员国具有相当于正规的国内申请的效力，该申请日也成为在该成员国的实际申请日。
PCT受理局将对国际PCT申请的文件进行形式审查，审查合格后则将国际PCT申请文件分别送交世界知识产权组织国际局和国际检索单位。
二、国际检索
PCT专利申请提交后，在规定的时间内，中国专利局作为国际检索单位将对PCT专利申请进行检索，并作出国际检索报告和一份书面意见。该检索报告将与书面意见一起在规定的时间内尽快送交PCT专利申请人和世界知识产权组织国际局。
自国际申请日（或优先权日）起满18个月后，国际局将公布PCT国际专利申请和国际检索单位作出的检索报告，并将该申请连同检索报告送交各成员国的专利局。与国际检索报告不同，书面意见不会同国际申请一起公布。
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三、国际初步审查
《专利合作条约》规定，国际初步审查程序不是强制性的，对于绝大部分成员国来说，也不是30个月进入国家阶段的条件。
国际初步审查的目的是为了就发明是否具有新颖性、创造性和实用性提出初步的意见。该审查意见对各个成员国没有任何约束力。但是，PCT规定的标准是当前国际上通用的标准,而且该审查意见是由为数不多的国际初步审查单位在国际检索的基础上作出的,所以该报告应当是比较可靠和可以依赖的。
中国专利局作为国际初步审查单位对国际申请进行审查后，将提出国际初步审查报告送交世界知识产权组织国际局并由国际局转交申请人，同时国际局还将国际初步审查报告送交给各成员国。
